Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdh20Q9Z0M3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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