Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms