Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gpc6Q9R087 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gpc6Q9R087 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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