Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a4Q9QZR9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms