Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn8Q9QZ49 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn8Q9QZ49 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms