Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Tomm40Q9QYA2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Tomm40Q9QYA2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Tomm40Q9QYA2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tomm40Q9QYA2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms