Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Limd1Q9QXD8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Limd1Q9QXD8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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