Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms