Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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