Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdcQ9QW08 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms