Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Csnk1eQ9JMK2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms