Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms