Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Col5a3Q9JLI2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a3Q9JLI2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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