Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nectin3Q9JLB9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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