Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FancaQ9JL70 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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FancaQ9JL70 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FancaQ9JL70 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms