Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms