Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trim39Q9ESN2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trim39Q9ESN2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim39Q9ESN2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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