Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ush1cQ9ES64 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms