Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clstn2Q9ER65 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clstn2Q9ER65 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms