Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms