Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clstn1Q9EPL2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms