Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Swt1Q9DBQ9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms