Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN5

Lonp2, Lon protease homolog 2, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonp2Q9DBN5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonp2Q9DBN5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms