Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chmp4cQ9D7F7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms