Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc94Q9D6J3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms