Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrameQ9D4Z5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms