Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lonrf3Q9D4H7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms