Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrnp35Q9D384 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms