Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx20Q9D2Y5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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