Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D2Q3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms