Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc6bQ9D289 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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