Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chordc1Q9D1P4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chordc1Q9D1P4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms