Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D1K7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms