Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Mrpl28Q9D1B9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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