Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hddc3Q9D114 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hddc3Q9D114 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hddc3Q9D114 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Hddc3Q9D114 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hddc3Q9D114 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hddc3Q9D114 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hddc3Q9D114 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hddc3Q9D114 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hddc3Q9D114 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms