Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Exosc7Q9D0M0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms