Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mms19Q9D071 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mms19Q9D071 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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