Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mis12Q9CY25 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mis12Q9CY25 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms