Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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