Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tmed5Q9CXE7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed5Q9CXE7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tmed5Q9CXE7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed5Q9CXE7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed5Q9CXE7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed5Q9CXE7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tmed5Q9CXE7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tmed5Q9CXE7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tmed5Q9CXE7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Tmed5Q9CXE7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Tmed5Q9CXE7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Tmed5Q9CXE7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed5Q9CXE7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tmed5Q9CXE7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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