Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rpusd4Q9CWX4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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