Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkrip1Q9CWV6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prkrip1Q9CWV6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms