Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
NubplQ9CWD8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms