Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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