Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms