Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1bQ9CSU0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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