Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9CRC3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CRC3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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