Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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