Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufb9Q9CQJ8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms