Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms